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诊断怀疑患有常染色体隐性多囊性肾脏疾病(ARPKD)的个体
产前诊断如果基于超声检查结果高度怀疑ARPKD
尚未确定患有ARPKD家族史的人的载体测试,但尚未确定受影响的个体进行测试或引起疾病的变体
该测试包括下一代测序,以评估PKHD1基因。可以执行Sanger测序以确认检测到的变体。
仅适用于产前标本:如果收到羊水(非相关培养细胞),则将分别添加并分别添加羊水培养/遗传测试。如果收到绒毛膜绒毛标本(非相关培养细胞),则将分别添加并分别添加用于基因检测的成纤维细胞培养物。对于任何接受的产前标本,将添加母体细胞污染研究。
常染色体隐性多囊性肾脏疾病(ARPKD)是由多囊肾脏和肝病引起的一种疾病(1PKHD1)基因。ARPKD的发生率约为1:20,000,一般人口中的估计载体频率为1:70。ARPKD的特征是回声肾脏肿大,先天性肝纤维化和肺部发育不全(子宫内少聚少聚糖量不足[羊水不足])。在新生儿期间,大多数患有ARPKD的人出现,其中近三分之一因呼吸不足而死。除了开始肾脏替代疗法(透析或移植)和呼吸支持外,早期诊断还显着提高了10年的存活率。表现症状包括婴儿的双侧可触摸侧肿块以及随后在肾脏超声检查的典型发现,通常是在高血压和产前寡素hydramnios的临床背景下。在稀有情况下,个人可能在儿童期或成年后与肝肾上腺肿。在那些在新生儿时期幸存下来的人中,终末期肾脏疾病和多达一半的肾脏肾脏不足。
这PKHD1基因地图至6p12,包括67个外显子。这PKHD1基因编码一种称为纤维囊蛋白的蛋白质,该蛋白质位于肾小管和胆汁上皮细胞的原发性纤毛和基础体内。由于ARPKD是一种常染色体隐性疾病,因此受影响的个体必须在PKHD1基因。尽管疾病的渗透率为100%,但已经观察到了疾病严重程度的肥胖内变异。由于较大的基因大小和跨基因整个长度的私人变体的流行,通常很难进行变体检测。
将提供解释性报告。
根据美国医学遗传学和基因组学学院(ACMG)建议,对所有检测到的变化进行了评估。(1)根据已知,预测或可能的致病性对变体进行分类,并用解释性评论进行了详细说明其潜在或已知意义的解释性评论。
一小部分人是载体或诊断为常染色体隐性多囊性肾脏疾病(ARPKD)的人可能具有该方法未鉴定的变体(例如,大型基因组删除/重复,启动子改变,深层内在变体)。因此,缺乏变体并不能消除阳性载体状态或ARPKD诊断的可能性。对于载体测试,重要的是首先记录存在多囊肾脏和肝病的存在1(PKHD1)受影响家庭成员的基因变体。
测试结果应在临床发现,家族史和其他实验室数据的背景下进行解释。如果给出的信息不准确或不完整,我们对结果的解释可能会发生错误。
技术局限性:
在某些情况下,可以鉴定出具有不确定意义的DNA变体。
存在罕见的改变(即多态性),可能导致假阴性或假阳性结果。如果获得的结果与临床结果不符,则应考虑其他测试。
评估工具:
使用多种硅胶评估工具来帮助解释这些结果。这些工具定期更新;因此,这些算法的变化可能会导致给定改变的预测不同。此外,目前未验证这些工具在确定致病性方面的可预测性。
除非报道或预测引起疾病,否则不会报告未导致氨基酸取代的蛋白质编码基因的改变。这些患者确定的这些和常见的更改可应要求提供。
变体的重新分类:
目前,实验室系统地审查先前已检测到和报告的不确定意义的变异的可能性改变或变体并不是标准实践。实验室鼓励医疗保健提供者随时与实验室联系,以了解特定变体的状态可能会随着时间而变化。
1. Richards S,Aziz N,Bale S等人:序列变体解释的标准和准则:美国医学遗传学与基因组学学院的共同共识和分子病理协会的共识。Genet Med 2015 5月; 17(5):405-424。doi:10.1038/gim.2015.30
2. Guay-Woodford LM,Desmond RA:常染色体隐性多囊肾脏疾病:北美的临床经验。儿科。2003; 111:1072-1080。doi:10.1542/peds.111.5.1072
3. Guay-Woodford LM,Bissler JJ,Braun MC等人:常染色体隐性隐性多囊性肾脏疾病的共识专家建议:国际会议的报告。J Pediatr。2014年9月; 165(3):611-617。doi:10.1016/j.jpeds.2014.06.015
4. Gunay-Aygun M,Avner E,Bacallao RL等:常染色体隐性多囊肾脏疾病和先天性肝纤维化:第一家国立卫生研究院/罕见疾病办公室会议的摘要。J Pediatr。2006; 149:159-164。doi:10.1016/j.jpeds.2006.03.014
5. Harris PC,Rossetti S:常染色体隐性多囊肾脏疾病的分子遗传学。mol Genet Metab。2004; 81:75-85。doi:10.1016/j.ymgme.2003.10.010