测试ID: TELGP
端粒基因缺陷面板

提供一个比较rehensive遗传评估个人或家族病史患者telomeropathies的暗示

telomeropathy建立一个诊断,在某些情况下,允许适当的管理和监测疾病的功能

确定致病基因变异在认识与风险增加有关端粒缺陷允许预测高危家庭成员的测试

这个测试包括下一代测序和补充Sanger测序基因上市小组来评估。

皮肤活检或培养的成纤维细胞标本,成纤维细胞培养和低温贮藏试验将额外的费用。如果没有获得可行的细胞中,客户端会通知。

端粒是高度专业化的结构组成的核苷酸TTAGGG重复和蛋白质,保护染色体末端。在正常情况下,端粒缩短与DNA复制的每一个周期。端粒酶是一种复杂的酶可以延长端粒的长度,从而帮助减缓缩短过程。端粒酶是最活跃的高度增殖淋巴细胞等组织,皮肤、小肠和骨髓。变异的基因参与端粒修复和维护可能导致染色体端粒缩短速度远远高于正常。

端粒生物学障碍(TBD)是一个复杂的组骨髓衰竭综合征的特点是异常短的端粒。这些症状的严重程度是可变的,他们可能会出现在儿童或成人。除了骨髓衰竭,端粒生物学疾病的其他症状包括肺纤维化、肝脏疾病、胃肠道疾病、和黏膜与皮肤的异常。识别和诊断潜在的TBD很重要,因为它可以帮助指导治疗决策。

角化病congenita (DC)是第一个有待描述。直流的子集包括经典直流,Hoyeraal Hreidarsson综合症(美国卫生和公众服务部),Revesz综合症,DC-like条件,孤立的亚型。患者DC的经典形式通常诊断在童年,他们有一个三位一体的黏膜与皮肤的功能,包括发育异常的指甲,皮肤色素异常,口腔黏膜白斑病。其他功能的DC可能包括骨髓衰竭、胃肠道疾病、肝脏疾病、肺纤维化、某些癌症的倾向,和其他医疗问题。其他TBD呈现在童年包括美国卫生和公众服务部和Revesz综合症。

TBD也体现在成年后可以变量和表示。大伞的条件可能包括骨髓衰竭、肺纤维化、肝病不分类,骨髓增生异常综合征、急性骨髓性白血病,或早发性直流分组内的恶性肿瘤。

端粒生物学障碍可以继承了多种模式,包括x连锁隐性、常染色体显性遗传、常染色体隐性。至少有50%的患者DC有突变叔,DKC1中,TERC TINF2 NHP2,和NOP10基因。在常染色体显性直流,表型可能呈现在一代又一代的年轻和更严重(遗传预期)。见下表总结的基因包含在这个面板中,相关的疾病,和继承的模式。

另外,有些病人可能有1这三个特性以及hypocellular骨髓。这些病人都有很短的端粒在白细胞(< 1%百分位的年龄)。美国卫生和公众服务部患者的特点经典直流但此外小脑发育不全。在白细胞端粒长度分析是由flow-FISH子集(参见参考资料)。他们也可以有低T细胞数量严重B和NK细胞淋巴细胞减少(T + / -B-NK)让人想起重度联合免疫缺陷(SCID)。在Revesz综合症,患者DC的双边渗出性视网膜病变以及其他特征。

在患者不符合直流的诊断标准,但有几个特征的疾病,DC-like可能应用的分类。这可能包括骨髓衰竭,发育迟缓,肺纤维化的家族历史,没有其他明确的诊断。这些患者通常有短,但不是很短的端粒,而且可能或不可能有遗传缺陷的一个已知的端粒生物学基因。然而,这些患者需要仔细监测可能演变成更多的经典形式的直流。个人基因突变的端粒和端粒短(< 1%百分位的正常年龄)一个端粒的功能障碍或直流可以被认为是一个独立的亚型。严格监控取决于个人的情况下,病人年龄、并发症,应包括咨询为家庭成员潜在的疾病风险和基因预测的现象。

再生障碍性贫血患者可能有突变叔,TERC,和TINF2基因。大约有20%的患者特发性肺纤维化(IPF)有家族性遗传,这是常染色体显性遗传,但可变外显率和大约30%的家族IPF患者有短端粒与端粒基因的遗传缺陷。最常见的基因识别IPF的上下文中,TERC和叔。

端粒酶复杂包括逆转录酶编码叔(编码、RNA模板,TERC),和相关的其他蛋白质调节组装、走私、招聘的端粒酶,端粒和端粒的稳定,包括dyskerin (DKC1中)。的其他成员包括端粒酶复杂NOP10(NOLA3)和NHP2(NOLA2)。shelterin复杂,这是一个6-protein复杂,外套端粒和端粒酶提供了保护。shelterin复杂指导端粒长度内稳态(T-loop)和防止DNA损伤反应的激活。DNA解旋酶,RTEL1促进端粒延伸通过T-loop的解除。TCAB1 (WRAP53)指导贩卖的端粒酶复杂特性的目的。中科复杂3蛋白(CTC1和其他人)抑制端粒酶活性,促进覆盖。

表。基因包含在这个面板

一个将提供解释报告。

执行评估和分类变量使用最近发表的美国大学医学遗传学和基因组学(ACMG)作为指导原则的建议。基于已知变异进行分类,预测,或可能的致病性和报告详细注释解释他们的潜在的或已知的意义。

多在网上评估工具可以用来帮助解释这些结果。预测的准确性由在硅片评估工具是高度依赖于数据对于一个给定的基因,和预测由这些工具可能随时间改变。结果在网上评估工具进行解释时应特别谨慎和专业临床判断。

除非报道或预测引起疾病,病变发现基因内区深处或改变不会导致一个氨基酸替换不报道。这些变异的信息、共同多态性可按照客户要求定制。

端粒酶的数据库是一个有用的工具变量审查和端粒障碍的分类,在某些情况下可以使用。

临床相关性:

一些人参与面板上的一个或多个基因可能的变体被执行的方法(如启动子变异、深intronic变异)。没有一个变体,因此,并不能消除疾病的可能性。测试结果应该在上下文中解释临床发现,家族史和其他实验室数据。误解的结果可能发生如果提供的信息不准确或不完整的。

预测检测无症状的个体,重要的是第一个文档的存在基因变异在一个家庭成员的影响。

短端粒可能存在于白细胞或颊与多种恶性肿瘤细胞。短端粒也被报道在良性的疾病如代谢条件,心血管疾病、糖尿病和吸烟。至少一半的患者BMFS或DC表型没有检测到变异在10基因测试面板,因此,可能会有额外的基因需要被发现。大多数情况下的端粒障碍似乎发生零星没有之前的家族史,这可能与不完全外显率,变量表达能力,或新创变体。是很重要的关联基因检测的数据与临床表型和其他相关测试,包括评估的端粒长度。

技术的局限性:

下一代测序可能无法检测所有类型的遗传变异。此外,罕见的改变(多态性)可能存在可能导致假阴性或假阳性结果。变异检测软件检测效率较低的插入/删除变体相比单核苷酸变异。因此,删除和插入小大于8个核苷酸长度可能不会被这个测试。拷贝数变异(CNV)目前不为任何报道的基因在这个面板。此外,罕见的多态性可能存在可能导致假阴性或假阳性结果。在某些情况下,DNA变异的待定意义可能是确定的。如果这个面板上的综合症的诊断仍怀疑,考虑一个实验室主任或基因顾问咨询。先前的骨髓移植同种异体的捐赠会干扰测试。电话800-533-1710说明测试的病人接受了骨髓移植手术。

Variants-Policy重新分类:

此时,它不是标准实践的实验室系统地审查可能致病变种或变异检测和报告的不确定的意义。实验室鼓励卫生保健提供者联系实验室随时了解一个特定的变体的状态随着时间的推移可能会改变。与医疗服务提供者咨询,医疗服务提供者或团队,专业知识在遗传学和原发性免疫缺陷,建议的解释这个结果。

良性和列表可能良性变异检测到这个病人可以从实验室要求。

联系实验室是否需要额外的信息关于成绩单或人类基因组组装用于分析这个病人的结果。

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• 基因检测的知情同意
• 原发性免疫缺陷患者信息