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测试ID: NGCDA
先天性造血障碍贫血小组,下一代测序,不同

有用的提示临床疾患或测试可能有用的环境

先天性造血障碍性贫血相关基因的诊断或载体突变状态的确认

识别与表型严重程度相关的基因突变,允许预测性测试和进一步的遗传咨询

遗传学测试信息提供有助于选择正确的基因检测或正确提交检测请求的信息

看到NGCDA下一代测序的目标基因在特别说明中列出的基因和外显子被这项测试的目标。

测试算法描述测试添加到初始顺序时的情况。这包括反射和其他测试。

看到NGHHA和子面板比较基因列表在特殊的指令。

临床信息讨论生理学,病理生理学,和一般的临床方面,因为他们涉及一个实验室测试

下一代测序(NGS)是一种方法,可以询问基因组DNA的大区域在一个单一的分析。基因突变的存在和模式可以为管理医生提供关键的诊断、预后和治疗信息。

该小组帮助诊断和遗传咨询的个人有临床或家族特征的先天性血液病贫血(CDA)。CDA是一种无效红细胞生成的疾病,临床上分为不同的亚型,不同的表型发现,分离成不同的基因关联。(1-4)这些疾病有独特的细胞病理学表现,包括骨髓红系前体的核异常。I型和II型CDA是常染色体隐性遗传,而III型和IV型是常染色体显性遗传。

参考价值描述用于解释测试结果的参考间隔和附加信息。在适当的时候,可能包括基于年龄和性别的间隔。除非另有说明,否则区间是由mayo导出的。如果提供了解释性报告,参考值字段将说明这一点。

将提供一份解释性报告。

解释提供信息以帮助解释测试结果

变异的评估和分类使用最新出版的美国医学遗传学学院的建议作为指南。(5,6)变异根据已知的、预测的或可能的致病性进行分类,并在报告时附带解释性评论,详细说明其潜在的或已知的重要性。

多种硅评价工具可用于帮助解释这些结果。硅评估工具做出的预测的准确性高度依赖于给定基因的可用数据,而这些工具做出的预测可能会随着时间的推移而改变。从硅评价工具的结果应该解释谨慎和专业的临床判断。

注意事项讨论可能导致诊断混淆的条件,包括不适当的标本收集和处理,不适当的测试选择和干扰物质

临床:

一些个体可能有突变,而这些突变不能被所执行的方法所识别。因此,突变的缺失并不能消除遗传性溶血性贫血或相关疾病的可能性。该试验不能区分种系和体细胞的改变,特别是变异等位基因频率(VAF)显著低于50%。检测结果应结合临床结果、家族史和其他实验室数据进行解释。如果所提供的资料不准确或不完整,可能会导致对结果的误解。

如果有遗传性溶血性贫血或相关疾病的家族史,通常对一级家庭成员进行检测,以帮助确定意义不明的变异的临床意义。

目前,实验室系统地审查以前检测和报告过的可能致病变异或意义不确定的变异不是标准做法。实验室鼓励卫生保健提供者随时与实验室联系,以了解特定变体的状态可能随时间发生的变化。

技术:

一些遗传或基因组的改变,如大的插入/删除(indel)事件,拷贝数改变和基因易位事件未被检测到。对于某些目标区域,覆盖的深度可能是可变的,但是低于最低可接受标准或失败区域的检测性能将被注意到。此外,罕见的多态性可能会导致假阴性或假阳性结果。如果结果与临床结果不匹配,考虑其他分析这些基因的方法,如Sanger测序或大缺失/重复分析。如果患者接受了异基因输血,由于存在供体DNA,这些结果可能不准确

临床参考推荐深入阅读的临床性质

1.Nathan and Oski’s婴幼儿血液学。编辑:SH Orkin, DG Nathan, D Ginsburg等。第七版。费城,Saunders Elsevier, 2009, pp 360-364

2.先天性造血障碍性贫血:分子生物学研究和诊断方法。血液2013年9月26日;122(13):2162-2166

3.Arnaud L, Saison C, Helias V等。红细胞转录因子KLF1编码基因的显性突变导致先天性造血障碍性贫血。Am J Hum Genet 2010 Nov 12;87(5):721-727

4.遗传性溶血性贫血患者应行脾切除术。2017年5月26日。PMID: 28550188。doi: 10.3324 / haematol.2016.161166

5.Richards S, Aziz N, Bale S等:序列变异解释的标准和指南:美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学协会的联合共识建议。Genet Med 2015 May;17(5):405-424

特殊指令包括与测试相关的相关信息和表格的pdf图书馆