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测试ID:GRHPZ
格拉姆基因,全基因分析,变化

对...有用提示临床疾患或测试可能有用的环境

确诊原发性高氧尿2型(PH2)

在没有家庭中没有已知的突变的情况下具有PH2家族史的个体的载体测试

测试算法在初始订单中添加测试时,描绘情况。这包括反射和额外的测试。

Hyperoxaluria诊断算法在特殊的指令。

临床信息讨论生理学,病理生理学和一般临床方面,因为它们与实验室测试有关

原发性高血管尿型2(pH2)是由肝酶乙醛酸还原酶/羟基吡合金还原酶缺乏引起的血氧化酶代谢的遗传性疾病(格拉姆)。没有GRHPR活性导致过量的草酸盐,并且通常在导致肾脏病(肾结石)和有时肾功能衰竭的尿液中排泄的L-甘露出。

PH2的发病通常发生在儿童或青少年时期,伴有肾结石相关症状。在某些情况下,肾衰竭可能是最初的表现特征。肾超声所见肾钙质沉积症在PH2患者中比原发性高草酸尿1型(PH1)患者更少见。终末期肾病(ESRD)也较PH1少,发病晚;然而,一旦ESRD发生,草酸盐沉积在其他器官,如骨、视网膜和心肌。

虽然PH2的确切患病率和发病率尚不清楚,但认为PH2不太常见于pH1,估计患病率为1%至每百万人口,发病率为0.1%/年。

在可能的原发性高血症尿尿患者中表明了生物化学测试。在定时测量尿酸盐,尿液24小时尿液收集是强烈的优选的,对儿科患者的成人体表面积进行校正(杂交/高血糖尿基,尿; Oxu /草酸,尿液)。在非常幼儿(不能进行定时收集)中,草酸尿酸盐对肌酐比的无规尿液可用于测定草酸盐排泄。在肾功能减少的患者中,也建议使用POXA /草酸盐。尿液酸盐> 1.0mmol / 1.73米(2)/ 24小时的尿液强烈暗示,但没有诊断为原发性高血糖尿素,因为还有其他形式的遗传性高血症(pH1和非pH1 / pH2)和继发性高血糖尿剂可能导致同样升高的尿液尿酸盐排泄率。在HealdoRuria存在下,尿液含量升高是PH2的暗示。警告在肾脏功能减少患者中泌尿草酸尿酸尿酸排泄的解释是有必要的,因为由于肾小球过滤速率降低,草酸盐浓度可能降低。从历史上看,通过对肝脏活组织检查进行的GRHPR酶分析证实了PH2的诊断;然而,这已被分子检测所取代,这在大多数情况下形成了确认或载体测试的基础。

pH2是由由突变引起的常染色体隐性疾病遗传格拉姆基因编码酶GRHPR。两个常见格拉姆已鉴定出突变:C.103delg和C.403_404 + 2delaagt。这些突变占北欧高加索人群中描述的约三分之一的突变等位基因,亚洲人口约为15%。直接测序格拉姆基因将鉴定这些2个突变以及与pH2相关的其他常见或新突变。

参考值描述参考间隔和其他信息以解释测试结果。可能包括适当时基于年龄和性别的间隔。除非另有说明,否则间隔是梅奥衍生的。如果提供了解释性报告,则参考值字段将陈述这一点。

将提供解释性报告。

解释提供信息以帮助解释测试结果

所有检测到的改变将根据美国医学遗传学和基因组学(ACMG)建议进行评估。(1)变体将基于已知的,预测或可能的致病性分类,并报告具有细节其潜在或已知意义的解释性评论。

注意事项讨论可能导致诊断混淆的条件,包括不当的标本收集和处理,不适当的测试选择和干扰物质

载体的小百分比载流子或诊断原发性高血糖尿蛋白2(pH2)可以具有未通过该方法(例如,启动子突变,深内肾衰)鉴定的突变。因此,不存在突变,不会消除阳性载流子状态的可能性或pH2的诊断。对于载体测试,首先记录存在的问题是重要的PH2.受影响家庭成员的基因突变。

除疾病相关的探针外,该测试还利用局部化为其他染色体区域的探针作为内部控制。在某些情况下,这些对照探针可能检测到该测试没有专门的疾病或条件。通常报道控制探针的结果。但是,如果确定了临床相关信息的情况下,将向订购医师通知该结果,并为任何适当的后续测试提供建议。

测试结果应在临床调查结果,家族史和其他实验室数据的背景下解释。如果给出的信息不准确或不完整,则可能会出现我们对结果的解释的错误。

技术限制:

在某些情况下,可能会发现意义不明的DNA变异。

由于下一代测序的局限性,该测试可能无法检测到小缺失和插入。如果仍然怀疑该面板上的综合征之一的诊断,请在800-533-1710在Genomics实验室中与有关随访测试选项的更多信息与基因组学实验室的分子遗传咨询辅助联系。

存在稀有多态性,可能导致假阴性或假阳性结果。如果获得的结果与临床结果不匹配,则应考虑额外的测试。

来自同种异体供体的先前骨髓移植将干扰测试。致电800-533-1710,用于测试接受骨髓移植的患者的说明。

评估工具:

使用多种硅基评估工具来帮助解释这些结果。这些工具定期更新;因此,对给定的更改的改变可能导致不同的预测。另外,目前未经验证这些用于测定致病性的这些工具的可预测性。

除非报告或预测引起疾病,否则未报道不会导致氨基酸取代的蛋白质编码基因的改变。可根据要求提供针对该患者的这些和常见的多态性。

重新分类变体 - 政策:

根据美国医学遗传学学院和基因组学建议,评估所有检测到的改变。基于已知的,预测或可能的致病性分类变体,并报告了细节其潜在或已知意义的解释性评论。此时,实验室没有标准做法,以系统地评估可能先前检测到和报道的不确定意义的致病性改变或变异。实验室鼓励医疗保健提供者随时与实验室联系,以了解特定变体的地位如何随时间变化。

临床参考推荐深入阅读的临床性质

1. Richards S,Aziz N,Bale S等人:解释序列变体的标准和准则:美国医学遗传学和基因组学和分子病理学协会的联合共识建议。Genet Med 2015年5月; 17(5):405-424

2.原发性高血糖尿型2-GenereViews-NCBI书架。可从URL:http://www.ncbi.nlm.nih.gov/books/nbk2692/访问8-7-2012

3. Rumsby G,Williams E,Coulter-Mackie M:突变筛查的评估作为诊断原发性高血糖尿的第一线试验。kidney int 2004; 66(3):959-963

4. Cregeen DP,Williams El,Hulton S,Rumsby G:乙醛还原酶的分子分析(格拉姆原发性高血糖型突变的基因和描述2.嗡嗡多的2003; 22(6):497

5.实验室和分子诊断原发性高血糖尿和草药。Mayo Medical Laboratories'Communique,2007年4月

特别说明PDF库包括与测试相关的相关信息和表格