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应用荧光原位杂交探针分析儿童肿瘤组临床试验和研究方案中与t细胞急性淋巴细胞白血病相关的经典重排和染色体拷贝数变化的儿童骨髓和外周血标本
细胞遗传学检测对于儿童肿瘤的诊断和预后分类非常重要,它是儿童肿瘤组(COG)临床试验中纳入儿童的关键因素。25年来,梅奥诊所基因组实验室一直是美国奥组委批准的一些实验室之一,用于儿童骨髓、外周血和组织标本的常规染色体分析和荧光原位杂交分析。梅奥诊所基因组实验室将按照COG的指导方针,以电子方式提交所有注册要求的细胞遗传学检测内容。
测试ID | 报告名称 | 可单独购买 | 总是表现 |
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_I099 | 间期,25 - 99 | 不,(仅法案) | 没有 |
_I300 | 间期,> = 100 | 不,(仅法案) | 没有 |
_IL25 | 间期,< 25 | 不,(仅法案) | 没有 |
_PADD | 探测器,+ 1 | 不,(仅法案) | 没有 |
_PB02 | 探测器,+ 2 | 不,(仅法案) | 没有 |
_PB03 | 探测器,+ 3 | 不,(仅法案) | 没有 |
_PBCT | 探测器,+ 2 | 不,(仅法案) | 没有 |
该测试仅对儿童肿瘤学组临床试验和研究方案的候选儿科患者标本进行。
对于t细胞急性淋巴母细胞白血病(T-ALL)患者推荐如下检测算法:
-在诊断时,应进行标准(诊断)T-ALL荧光原位杂交(FISH)和/或常规染色体研究,COGBM /染色体分析,血液学疾病,儿童肿瘤组登记检测,骨髓。如果样本有限,将只进行COGTF / t细胞急性淋巴母细胞白血病(T-ALL)、儿童肿瘤组登记试验、FISH、各试验。
面板包括使用列出的探头检测以下异常情况:
1 p33重排,TAL1 /保修期内
t (5; 14)TLX3/BCL11B
7 q34重排,交通研究
9 p -,CDKN2A/D9Z1
t(9、22)ABL1放大,BCR/ABL1
t(10、11),MLLT10/PICALM
11 q23处重排,MLL(KMT2A)
14 q11.2重排,传统的
17 p -,TP53/D17Z1
当一个MLL(KMT2A),将进行反射测试以确定易位伙伴。探针包括t(4;11)(q21;q23)的识别AFF1/MLL,t(6; 11)(问;q23处)MLLT4/MLL,t(9、11)(第22位;q23处)MLLT3/MLL,t(10、11)(p13; q23处)MLLT10/MLL,t(11、19)(q23处;p13.1)MLL/l形的或t(11、19)(q23处;p13.3)MLL/MLLT1。
当一个传统的确定重排后,将进行反射测试以确定易位伙伴。探针包括t(8;14)(q24.1;q11.2)的识别MYC/传统的,t(10; 14)(抓起;q11.2)TLX1/传统的,t(11、14)(p15; q11.2)LMO1/传统的或t(11、14)(p13; q11.2)LMO2/传统的。
当一个交通研究确定重排后,将进行反射测试以确定易位伙伴。探针包括t(7;10)(q34;q24)的鉴定交通研究/HOX11,t(7、11)(q34; p15)交通研究/LMO1t (7; 11) (q34; p13)交通研究/LMO2或t(6、7)(问;q34)交通研究/MYB。
-如果要求进行该检查,而实验室被告知患者不符合COG协议,则该检查将被取消,并由实验室自动重新排序为TALLF / t细胞急性淋巴母细胞白血病(T-ALL), FISH,各不相同。
荧光原位杂交(FISH)