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测试ID:DPYDG
二氢嘧啶脱氢酶,DPYD全基因测序,变化

有用的建议测试可能有用的临床障碍或设置

在考虑5-氟尿嘧啶和卡培他滨化疗时确定有较高毒性风险的个体

可用于鉴定与这种缺乏可疑的个体的缺点或未存在的二氢嘧啶脱氢酶活性相关的变体

遗传学测试信息提供可能有助于选择正确的遗传测试或适当提交测试请求的信息

临床信息讨论生理学,病理生理学和一般临床方面,因为它们与实验室测试有关

5-氟尿嘧啶(5-FU)及其口服给药的前药Capecitabine是氟嘧啶的化学治疗剂,广泛用于治疗结直肠癌和其他实体瘤。

二氢嘧啶脱氢酶(DPYD)基因对氟嘧啶分解代谢的速率限制酶进行编码,并消除超过80%的施用5-FU。二氢嘧啶脱氢酶(DPYD)活性受到广泛的可变性,主要是由于遗传变异(表1)。这导致部分(3%-5%)的酶促缺陷的广泛(3%-5%),以完全丧生(群体的0.2%)酶活性。(2,3)在DPYD缺乏的患者处于增加风险副作用和毒性在进行5-FU处理时。(4)此外,病原纯合或复合杂合子变体内DPYD与二氢嘧啶脱氢酶(DPD)缺乏有关。DPD缺陷表现出很大的表型变异性,从无症状到伴有运动和智力发育迟缓的抽搐障碍。

表1.与氟嘧啶处理相关的已知遗传变异

基因

cDNA编号

选择的名字

酶活性

表型?

DPYD

没有确定变化

* 1

c.1905 + 1 g - >

* 2个

没有活动或显着减少活动

氟嘧啶毒性高风险

C.1679T-> G.

* 13.

c.1898delC

* 3.

c.299_302delTCAT

* 7.

c.1156G - > T

* 12.

C.2846A-> T.

RS67376798

减少活动

氟嘧啶毒性风险增加

c.1129 - 5923 c - G >

RS75017182

C.703C-> T.

* 8.

可能减少函数

氟嘧啶毒性风险增加

c.2983G - > T

* 10.

C.1003G-> T.

* 11.

c.557A - >克

RS115232898

c.1601C - > T

* 4.

正常活动**

氟嘧啶毒性的正常风险

c.1627A - >克

* 5.

C.2194C-> T.

* 6.

c.85T - > C

* 9

*除了这里列出的,其他或新的变异也可能影响氟嘧啶相关的副作用和肿瘤反应,如果发现将报告。

**被归类为具有正常酶活性的等位基因(如*4,*5,*6,*9A)如果检测到将不会被报告,因为酶活性正常的变异预计不会影响氟嘧啶相关的副作用和肿瘤反应。

DPYD基因位于1号染色体上,包含2个转录本。较长的转录本(NM_000110.3)包含23个外显子,较短的转录本(NM_001160301.1)包含6个外显子,其中第6个外显子是该转录本特有的。从较长的转录本(NM_000110.3)和外显子-内含子边界的所有外显子被评估。

氟嘧啶代谢途径中涉及的遗传变异已被证明有助于临床结果的差异,包括毒性和肿瘤反应。

参考值描述参考间隔和其他信息以解释测试结果。可能包括适当时基于年龄和性别的间隔。除非另有说明,否则间隔是梅奥衍生的。如果提供了解释性报告,则参考值字段将陈述这一点。

将提供一份解释性报告。

解释提供有助于解释测试结果的信息

(5)根据已知、预测或可能的致病性对变异进行分类,并报告解释性评论,详细说明它们的潜在或已知意义。

有关药物基因组基因及其相关药物的更多信息,请参见药物基因组学关联表在特殊说明中。该资源还包括关于酶抑制剂和诱导剂的信息,以及潜在的替代药物选择。

注意讨论可能导致诊断混乱的条件,包括不适当的标本采集和处理,不适当的试验选择和干扰物质

如果从接受异源性输血或同种异体血液或骨髓移植的患者获得,样品可能含有供体DNA。在这些情况下获得的样品的结果可能无法准确反映受体的基因型。对于接受输血的个体,基因型通常在6周内恢复到接受者的那些。对于接受同种异体血液或骨髓移植的个体,建议使用预体DNA标本进行测试。

Dihydropyrimidine脱氢酶(DPYD)肝移植患者的基因检测结果可能不能准确反映患者的DPYD状态。

存在可能导致假阴性或假阳性结果的罕见遗传变异。引物结合区域的其他变异可以影响检测,并最终影响基因型评估。

检测结果应结合临床表现、家族史和其他实验室数据进行解释。本试验未检测到大的缺失或重排,这可能影响DPYD蛋白的表达及其对氟嘧啶相关副作用和肿瘤反应的影响。

有时可能鉴定出意义不明的遗传变化。在这种情况下,对适当的家庭成员进行测试可能有助于确定变异的致病性。

本试验的目的不是提供特定的剂量或药物选择建议,仅用于辅助临床决策。在给患者用药时,无论预测的表型如何,都应使用药物标签指南。

临床参考深入阅读临床性质的建议

1.OMIM: 274270二氢嘧啶脱氢酶缺乏。约翰霍普金斯大学;1986.2012年4月18日更新。2020年12月4日。可以从https://www.omim.org/entry/274270

2.Caudle KE, Thorn CF, Klein TE,等:二氢嘧啶脱氢酶基因型和氟嘧啶剂量的临床药物遗传学实施联盟指南。临床药理学杂志。2013;94(6):640-645

3. Morel A,Boisdron-Celle M,Fey L等:不同二嘧啶脱氢酶基因单核苷酸多态性对5-氟尿嘧啶耐受性的临床相关性。莫癌。2006年11月5日(11):2895-2904

4.美国食品和药物管理局(FDA):药物标签中药学生物标志物表。FDA;Updationed 6月20日,访问了2020年12月4日。提供:www.fda.gov/rugs/scienceresearch/researchareas/pharmacogenetics/ucm083378.htm

5. Richards S,Aziz N,Bale S等人:序列变体解释的标准和准则:美国医学遗传学和基因组学和分子病理协会的联合共识建议。Genet Med。2015; 17(5):405-424

6.Offer SM, Fossum CC, Wegner NJ,等:DPYD变异与二氢嘧啶脱氢酶活性潜在临床相关性的功能比较分析。实用癌症杂志2014;74 (9):2545 - 2554

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