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测试ID:HCRC
遗传性结肠癌多基因图谱,各不相同

有用的建议临床疾病或测试可能有帮助的环境

对有遗传性结肠癌综合征的个人或家族病史的患者提供遗传性结肠癌的综合评估

用于针对特定遗传结肠直肠癌相关基因的先前靶向基因变异分析的患者的第二层测试是阴性的

在某些情况下建立遗传结肠癌综合征的诊断,允许有针对性的癌症监测到已知癌症的增加风险

鉴定已知基因内的变体与结肠癌的风险增加有关,允许预测对风险的家庭成员的预测测试

遗传学测试信息提供可能有助于选择正确的遗传测试或适当提交测试请求的信息

该测试包括下一代测序,Sanger测序,阵列比较基因组杂交,以及多重连接依赖性探针扩增,以评估面板上列出的基因。

之前的授权可用于本分析;看到特殊指令

看到患有遗传结肠癌面板的靶向基因区域详细信息请参阅本试验所鉴定的靶向基因区域。

测试算法在初始订单中添加测试时,描绘情况。这包括反射和额外的测试。

临床信息讨论生理学,病理生理学和一般临床方面,因为它们与实验室测试有关

结直肠癌发生在一般人群中大约5%到6%的个体。在极少数情况下,有结肠直肠癌家族史的个体,由于单基因易感性综合征(即遗传性结肠直肠癌),患结肠和其他癌症的风险可能会增加。2种最常见的遗传性结直肠癌综合征是林奇综合征和家族性腺瘤性息肉病(FAP)。然而,还有许多其他基因也被认为会导致遗传性结直肠癌或增加结直肠癌的风险。该小组使用下一代测序(NGS)、阵列比较基因组杂交(aCGH)和其他技术来评估已知与结肠癌发展风险增加相关的17个基因的种系变异。列出的两个基因,CHEK2MLH3.,与已知的遗传性癌症综合征无关,由不同的肿瘤范围定义。然而,文献表明这些基因中的变体可以赋予结肠癌的风险增加,因此预计患者和家庭的癌症风险有助于患有癌症风险。

基因

已知协会

MLH1.

林奇综合征

MSH2

林奇综合征

MSH6.

林奇综合征

PMS2.

林奇综合征

EPCAM

林奇综合征

APC

家族性腺瘤息肉病

myh / mutyh.

MYH- 分配的息肉蛋白

SCG5 / GREM1

遗传性混合息肉综合征

STK11.

Peutz-Jeghers综合症

Smad4.

少年息肉病综合征

bmpr1a.

少年息肉病综合征

PTEN.

PTEN.Hamartoma肿瘤综合征(即Cowden综合征)

CDH1

遗传性弥漫性胃癌

AXIN2.

Oligodontia-colorectal癌综合征

TP53

Li-Fraumeni综合征

CHEK2

低风险基因

MLH3.

低风险基因

测试的迹象包括但不限于:

-没有明显的特定结肠直肠癌综合征,但有明确家族成分的患者

-家族病史与家族性X型大肠癌一致的患者(1)

- 基于家庭中结肠癌的常染色体显性模式,对单基因遗传性结肠癌综合征有强怀疑的

- 具有结肠息肉病的个人或家族史

参考值描述参考间隔和其他信息以解释测试结果。可能包括适当时基于年龄和性别的间隔。除非另有说明,否则间隔是梅奥衍生的。如果提供了解释性报告,则参考值字段将陈述这一点。

将提供一份解释性报告。

解释提供有助于解释测试结果的信息

根据美国医学遗传学和基因组学学院的建议,对所有检测到的变异进行评估。(2)根据已知、预测或可能的致病性对变异进行分类,并报告解释性评论,详细说明它们的潜在或已知意义。

注意事项讨论可能导致诊断混乱的条件,包括不适当的标本采集和处理,不适当的试验选择和干扰物质

临床相关性:

一些参与了面板上1个或更多基因的个体可能有一种不能被所执行的方法识别的变异(例如,启动子改变,深度内含子改变)。因此,变异的缺失并不能排除遗传性结直肠癌综合征或其他遗传性结肠癌风险的可能性。对于无症状个体的预测检测,首先证明在受影响的家庭成员中存在基因变异是很重要的。

检测结果应结合临床表现、家族史和其他实验室数据进行解释。如果提供的信息不准确或不完整,可能会导致对结果的误解。

技术的局限性:

在某些情况下,可以鉴定出意义不明的DNA变异。

由于下一代测序的局限性,长度大于8个核苷酸的小缺失和插入将不会被该测试检测到。如果该小组对其中一种综合征的诊断仍有怀疑,考虑使用传统的桑格方法进行全基因测序。通过阵列比较基因组杂交(aCGH)检测单个或多个外显子缺失以及全基因缺失。

存在可能导致假阴性或假阳性结果的罕见变化。如果获得的结果与临床结果不一致,则应考虑进行额外的检测。

除了疾病相关的探针之外,多重连接依赖性探针扩增技术利用局部化为其他染色体区域的探针作为内部控制。在某些情况下,这些对照探针可能检测到该测试没有专门的疾病或条件。通常报道控制探针的结果。但是,如果确定了临床相关信息的情况下,将向订购医师通知该结果,并为任何适当的后续测试提供建议。

评估工具:

多种硅质评价工具被用于帮助解释这些结果。这些工具定期更新;因此,对这些算法的更改可能导致对给定更改的不同预测。此外,这些工具在确定致病性方面的可预测性目前还没有得到验证。

除非报告或预测导致疾病,否则未报告在没有导致氨基酸替代的内含子或改变中的改变。可根据要求提供为该患者确定的这些和常见的改变。

Variants-Policy重新分类:

目前,实验室系统地审查检测和报告的可能有害的改变或意义不确定的变体还不是标准做法。实验室鼓励卫生保健提供者随时与实验室联系,以了解某一特定变体的状态随时间的变化情况。

临床参考深入阅读临床性质的建议

1.Lindor NM, Rabe K, Petersen GM,等:阿姆斯特丹- i标准家庭中无错配修复缺陷的低癌症发生率:家族性结直肠癌x型JAMA。2005; 293 (16): 1979 - 1985

2.Richards S, Aziz N, Bale S,等:解释序列变异的标准和指南:美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学协会的联合共识建议。Genet Med. 2015 May;17(5):405-424

3.Lindor NM, McMaster ML, Lindor CJ, Greene MH,国家癌症研究所,癌症预防部门,社区肿瘤和预防试验研究组:家族性癌症易感性综合征简明手册第二版。中国癌症杂志,2008;(38):1-93

4.Masciari S, Syngal S:角色P53.在结肠直肠癌。In: Potter JD, linor NM, eds。大肠癌的遗传学。施普林格-;2009:213 - 217

5.Jaeger E, Leedham S, Lewis A,等:遗传性混合息肉病综合征是由40 kb的上游复制导致BMP拮抗剂的增加和异位表达引起的格雷米1..NAT Genet。2012; 44(6):699-703

6. Ligtenberg MJL,Kuiper Rp,Chan TL,等:遗传体细胞甲基化和灭活MSH2由于删除了3'外显子,在林奇综合征的家庭中Tacstd1..Nat麝猫。2009;41 (1):112 - 117

7.Lammi L, Arte S, Somer M,等:突变AXIN2.导致家族性牙齿发育不全,易患结直肠癌。Am J Hum Genet 2004;74:1043-1050

8.刘红霞,周晓莉,刘涛,等:hMLH3在家族性结直肠癌中的作用。实用癌症杂志2003;63 (8):1894 - 1899

特别说明PDF库包括与测试相关的相关信息和表格