序列抓取和定向下调序后继聚合物链响应和Sanger定序
伯特
伯特霍格
Birt-Hogg-Dube
BHD语言
BHD综合症
BHDS系统
extGen定序测试
单基因
Fibrofolliculoma
Trichodiscoma
Angiofibroma
充气管
Perifollical纤维质
肾癌
遗传癌症
福里库林
变迁
综合遗传肾癌基因板研究RENCP/转基因癌症板研究Varies测试19个基因包括FLCN.
测试FLCN基因部分定制面板可用更多资料见CGPH/自定义Gene面板、推理学、下一序号、Varies
面向家庭变异测试(也称网站专用或已知变异测试)可供此基因使用更多信息见FMTT/Familical变换、定向测试、Varies
病人准备:原骨髓移植自配方会干扰测试电话800-533-1710测试接受骨髓移植的病人指令
特征类型 :全血
容器/图贝:
首选 :淡顶部或黄顶
可接受性:任何抗coaplan
样本量 :3mL
集合指令 :
开工多次反转混合血液
二叉原创管寄标本不阿里夸特
特征稳定信息Ambient4天/冷冻
开工纽约客户端非格式化协议文档请求表或电子命令副本存档下列文件在特殊指令中提供:
-知情录用基因测试576
-知情基因测试(西班牙语)T826
二叉分子遗传学:继承癌症综合症患者信息表519特殊指令
3级非电子排序完整打印发送肿瘤测试请求729带标本
见Specimen必备
特征类型 | 温度学 | 时间轴 | 专用容器 |
---|---|---|---|
变迁 | Varies(首选) |
Germline变量FLCN基因连接Birt-Hogg-Dube综合症BHD综合症特征为切片表现物(Fibrofollicos/angiofibromas、 PerifollicalFibromas和acroBHD综合症以自片支配方式继承,穿透度被认为非常高。
虽然对BHD综合症的临床监控没有达成共识,但国家癌症研究所等不同集团为该综合症的单个表现提出了许多建议。
提供解析报告
检测到的变量都根据美国医学遗传学和基因学学院的建议评价。 (7) 变量根据已知性、预测性或可能的致病性分类并用解释性评论报告,详细说明其潜在或已知意义
临床关联度 :
测试结果应结合临床发现、家庭历史和其他实验室数据理解信息不准确或不完整时,结果误解可能发生
如果测试是由于临床上意义重大的家族历史完成的,则通常宜先测试受影响的家庭成员检测受影响家庭成员中可报告变异可允许对风险个人作更多信息测试
讨论额外测试选项的可用性或帮助解释这些结果时,联系Mayo实验室遗传咨询师800-533-1710.
技术约束
下一代测序可能检测不到所有类型基因组变异稀有案例可能出现假阴性或假阳性结果深度覆盖对目标区域可变性分析性能低于最低可接受标准或失灵区域基于这些限制,负结果并不排除诊断遗传失序疑似特定临床失序时,可考虑替代方法评价
可能有些区域基因无法通过排序或删除和重复分析有效评价,这些区域包括同族学区域、高抗量子素内容区和重复序列选择可报告变异性确认工作将以内部实验室标准为基础用替代方法完成
测试验证95%删除至75基对并插入至47b插入/删除分量40或以上b
删除/重复分析:本分析目标单倍删除/重复然而,在某些情况下单前解法无法实现,原因是单次减少序列覆盖或固有基因组复杂性平衡结构重排列(如移位和反转等)可能检测不到
本测试设计不是为了检测低层次马赛斯或区分声波变异和子波变异万一检测到的变异体可能有体性,可能需要额外测试以澄清结果意义
有关基因特效和技术约束的详细信息见方法描述或联系实验室遗传咨询师
如果病人有异形异构干细胞移植或最近异式输血,结果可能不准确,因为有捐献式脱氧核糖核酸betway中国版调用mao诊所实验室指令测试接受骨髓移植的病人
变式重新分类:
此时,实验室系统审查先前分类变异非标准做法实验室鼓励保健提供者随时联系实验室学习特定变异分类可能随时间变化
变换评价:
变量评价和分类使用出版的美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学建议协会指导也可考虑其他基因专用指南变量根据已知性、预测性或可能的致病性分类并用解释性注释报告,详细说明其潜在或已知意义分类为良性或似良性变量不报告
多线程评价工具可用于帮助解释这些结果硅评价工具预测精度高度依赖特定基因可用数据,定期更新这些工具可能导致预测随时间变化silco评价工具结果应谨慎解读和专业临床判断
开工attlerECSteinlein确定:Birt-Hogg-Dube综合症插文:Adam MP、Ardinger HH、Pagon RA等编辑Gene审查..华府西雅图2006年1月30日更新 2020访问2021年7月6日Available at: www.ncbi.nlm.nih.gov/books/NBK1522/
二叉HouwelingAC公司、GijezenLM公司、JonekerMA公司等:Birt-Hogg-Dube综合症Renal癌症和Nemothorax风险分析35个BHD家庭115FLN变异载体BRJ癌症2011年12月6日;105(12):1912-1919
3级SchmidtLS,NickersonML,WarrenMB等:GermlineBHD变换频谱和phone类型分析一大批Birt-Hogg-Dube综合症家庭AMJHumGenetJun2005;76(6):1023-1033
4级Stamakis L,MetwalliAR,Middelton LA,LinehanWM:诊断和管理BHD相关肾癌家庭癌症2013sep;12(3):397-402
5级Farrant PBJEmerson R:信:hyfrecation和criptation处理Birt-Hogg-Dube综合症Fibrofollicloma德马托尔Surg2007Oct;33(10):1287-1288
6级金DWysongATNJMZLANSLAND德马托尔Surg2019年12月45日
7理查斯S、AzizN和BaleS等:解释序列变异的标准和指南:美国医学遗传学和基因组学学院和分子病理学协会联合协商一致建议基因医疗2015年5月17(5):405-424
下一代测序和/或Sanger测序测试编码区和数子/exFLCN基因分析 和其他一些区域 已知病原体变异人类基因组参考GRCh37/hg19构建用于序列阅读对齐至少有99%的基底覆盖深度超过30X单核变异估计感知度99%以上,插入/删除小于40基对94%以上,删除最大达75bp和插入最大达47bs和/或聚合物链反射法测试基因分析中是否存在删除和复制
可能有些区域基因无法通过排序或删除和重复分析有效评价,这些区域包括同族学区域、高抗量子素内容区和重复序列参考转录FLCN基因NM144997.7引用转录数可因转录复用而更新常参考最终病人报告基因笔录信息测试时引用
选择报告变异可用替代方法进行确认,该替代方法基于内部实验室标准。
变迁
测试开发完成,性能特征由maioClinic以符合CLIA要求的方式确定测试未经美国食品药管局审核或批准
81479
测试i | 测试顺序名 | 指令LOINC值 |
---|---|---|
BHDZ系统 | FLCN全基因分析 | 94232-6 |
结果Id | 测试结果名 | 结果LOINC值
仅适用于执行实验室最初报告的单位计量结果值并不适用于转换为其他度量单位的结果
|
---|---|---|
614635 | 测试描述 | 62364-5 |
614636 | 样板 | 3208-2 |
614637 | 源码 | 3208-2 |
614638 | 结果汇总 | 50397-9 |
614639 | 结果 | 82939-0 |
614640 | 传译 | 69047-9 |
614641 | 资源类 | 99622-3 |
614642 | 附加信息 | 48767-8 |
614643 | 方法论 | 850693 |
614644 | Genes解析 | 48018-6 |
614645 | 免责声明 | 62364-5 |
6146 | 发布方式 | 18771-6 |