识别实体肿瘤同时评估可能对靶向治疗的重组涉及的目标区域NTRK1,NTRK2,NTRK3基因融合转录本
这个测试是不是有用的血液恶性肿瘤。
这个测试使用下一代测序确定重组涉及的目标区域的(融合)NTRK1 NTRK2,和NTRK3基因。
试验的目的是检测最常见NTRK基因融合和小说基因融合目标基因区域的合作伙伴。看到NTRK RNA基因融合的目标表中特殊说明细节。
值得注意的是,这个测试执行评估重组(融合)固体肿瘤样本。这个测试是不适用的血液恶性肿瘤。
这个测试评估formalin-fixed,晚期实体肿瘤患者的肿瘤石蜡包埋的幻灯片重组涉及的目标区域的(融合)NTRK1,NTRK2,NTRK3确定候选基因靶向治疗。当前数据表明,实体肿瘤NTRKmultikinase重组可能是敏感抑制剂。
测试Id | 报告名称 | 可单独购买 | 总是表现 |
---|---|---|---|
SLIRV | 幻灯片回顾在毫克 | 不,(仅法案) | 是的 |
这个测试命令时,幻灯片回顾总是会执行一个额外的费用。
聚合酶链反应(PCR)的下一代测序(门店)
接下来一代测序测试
总会在
肿瘤学面板
肿瘤小组
NTRK
NTRK1
NTRK2
NTRK3
这个测试命令时,幻灯片回顾总是会执行一个额外的费用。
不同
病理报告(最终或初步)至少包含以下信息必须伴随标本为了测试执行:
1。患者姓名
2。块数字必须是对所有块,幻灯片和文书工作(可以手写的文件)
3所示。组织收集日期
4所示。源的组织
这个实验需要至少10%的肿瘤细胞核。
首选的肿瘤区域有足够的百分比肿瘤细胞核:tissue144毫米(2)
最小数量的肿瘤区域:组织36毫米(2)。
这些数量累计超过10清白的幻灯片,必须有足够的百分比肿瘤细胞核。
组织固定:10%中性缓冲福尔马林,不脱钙
——样品制备的指导,请参阅实体瘤组织要求下一代测序在特殊的指令。在本文档中,给出的尺寸4毫米x 4毫米x 10幻灯片作为首选:近似/相当于144毫米(2)和最低3毫米x 1毫米x 10幻灯片:近似/相当于36毫米(2)。
首选:
样品类型:组织块
收集产品说明:提交formalin-fixed,石蜡包埋组织块可接受数量的肿瘤组织。
可以接受的:
样品类型:组织的幻灯片
幻灯片:1彩色和10个清白的
收集产品说明:提交1张幻灯片与苏木精和伊红染色和10清白的,nonbaked幻灯片5微米厚的部分肿瘤组织。
注意:需要肿瘤细胞核的总量可以通过刮10幻灯片从同一块。
如果不是电子订购,完成,打印和发送肿瘤学试验要求(T729)标本。
看到标本要求
其他 | 标本已脱钙(所有方法)标本,尚未formalin-fixed,石蜡包埋 |
标本类型 | 温度 | 时间 | 特种集装箱 |
---|---|---|---|
不同 | 环境(首选) | ||
冻 | |||
冷藏 |
识别实体肿瘤同时评估可能对靶向治疗的重组涉及的目标区域NTRK1,NTRK2,NTRK3基因融合转录本
这个测试是不是有用的血液恶性肿瘤。
这个测试使用下一代测序确定重组涉及的目标区域的(融合)NTRK1 NTRK2,和NTRK3基因。
试验的目的是检测最常见NTRK基因融合和小说基因融合目标基因区域的合作伙伴。看到NTRK RNA基因融合的目标表中特殊说明细节。
值得注意的是,这个测试执行评估重组(融合)固体肿瘤样本。这个测试是不适用的血液恶性肿瘤。
这个测试命令时,幻灯片回顾总是会执行一个额外的费用。
有针对性的癌症疗法被定义为抗体或小分子药物阻断癌症的生长和传播通过干扰细胞的特定分子参与肿瘤的生长和发展。多个靶向治疗已被FDA批准用于治疗特定的癌症。分子遗传学分析通常需要确定目标服从于靶向治疗和治疗费用和治疗相关性风险降到最低。
融合涉及NTRK1,NTRK2,或NTRK3基因(即NTRK基因融合)通过内部和染色体间重组形式。NTRK基因融合导致激活下游MAPK的青瓷和STAT3信号通路和作为致癌司机的多种类型的儿童和成人的实体肿瘤。实体肿瘤的存在NTRK基因融合是应对原肌球蛋白受体激酶的生物标志物(TRK)抑制剂治疗。
这对融合涉及测试评估NTRK1,NTRK2,NTRK3基因。本次测试的结果可用于指导治疗的先进的实体肿瘤。
看到NTRKRNA靶向基因融合表中特殊指令目标基因的详细信息区域评估这个测试。
一个将提供解释报告。
一个将提供解释报告。
这个测试不是为了区分体细胞和生殖系变化。额外的测试可能需要澄清结果的意义是否有潜在的遗传风险。
负(野生型)结果不排除存在重排(融合)可能存在但低于极限的检测分析。这个试验的分析灵敏度是一个最小覆盖10个目标融合读5独特融合分子与10%或更大的肿瘤样本内容。
只有基因重组(融合)包括有针对性的断点NTRK1, NTRK2, NTRK3基因将被检测到。这个测试没有发现点突变,插入/删除突变,大单或multiexon删除或复制,或基因组拷贝数变异的基因测试。
罕见的多态性可能存在可能导致假阴性或假阳性结果。测试结果应解释在临床中发现,肿瘤采样,和其他实验室数据。如果结果不匹配其他临床或实验室发现,联系实验室更新的解释。误解的结果可能发生如果提供的信息不准确或不完整的。
可靠的结果依赖于足够的样本收集和处理。这个测试已验证formalin-fixed,石蜡包埋组织;其他类型的固定液是气馁。组织的治疗不当,如脱钙作用,可能会导致PCR失败。
1。Drilon, Laetsch TW Kummar年代:功效的Larotrectinib TRK Fusion-Positive在成人和儿童癌症。N拉米夫地中海2018年2月22日,378 (8):731 - 739doi: 10.1056 / NEJMoa1714448
2。Cocco E, Scaltriti M, Drilon答:NTRK fusion-positive癌症和TRK抑制剂治疗。Nat牧师肿瘤防治杂志2018年12月,15 (12):731 - 747doi: 10.1038 / s41571 - 018 - 0113 - 0
下一代测序(上天)执行测试重组涉及目标断点的存在的NTRK1 NTRK2,和NTRK3基因。重排命名法是基于一个自定义的参考序列使用基因组构建GRCh37 (hg19)。看到NTRKRNA靶向基因融合有关详细信息,关于这个测试发现的有针对性的基因区域。(未发表的梅奥法)
星期一到星期五
这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。
81194年
幻灯片回顾
88381 -显微解剖,手册
测试Id | 测试顺序的名字 | 订单LOINC价值 |
---|---|---|
NTRK | NTRK基因融合小组 | 93813 - 4 |
结果Id | 测试结果的名字 | 结果LOINC值
仅适用于测量结果表示在单位最初报告的执行实验室。并不适用于这些值转换为其他单位的测量结果。
|
---|---|---|
606761年 | 结果总结 | 50397 - 9 |
606762年 | 结果 | 81286 - 7 |
606763年 | 解释 | 69047 - 9 |
606764年 | 额外的信息 | 48767 - 8 |
606765年 | 标本 | 31208 - 2 |
606766年 | 源 | 31208 - 2 |
606767年 | 组织ID | 80398 - 1 |
606768年 | 发布的 | 18771 - 6 |