作为新诊断的急性脊髓性白血病患者的预后指标,核型正常,无flt3变体和作为最小残留疾病的白血病特异性标记
提取DNA和RNA。该测定由2个部分组成,这是一种基于RNA的,敏感的定量逆转录实时聚合酶链反应(RT-PCR),可检测和量化最常见的改变NPM1急性髓样白血病(AML)和基于DNA的定性,信使RNA转录本(A,B,D形式)NPM1通过片段分析进行外显子12变体筛选,该变体分析基本上检测到AML中报道的所有改变形式,包括罕见的non-a,b,d形式(在DNA水平上具有较低的灵敏度)。
RNA:反向转录定量PCR(RT-QPCR)
DNA:通过毛细血管电泳分析的聚合酶链反应(PCR),分析片段
NPM1
核素突变分析
提取DNA和RNA。该测定由2个部分组成,这是一种基于RNA的,敏感的定量逆转录实时聚合酶链反应(RT-PCR),可检测和量化最常见的改变NPM1急性髓样白血病(AML)和基于DNA的定性,信使RNA转录本(A,B,D形式)NPM1通过片段分析进行外显子12变体筛选,该变体分析基本上检测到AML中报道的所有改变形式,包括罕见的non-a,b,d形式(在DNA水平上具有较低的灵敏度)。
变化
冷藏标本必须在收集后的5天内到达,并且环境标本必须在收集后3天内到达。收集和包装标本尽可能接近运输时间。
需要以下信息:
1.相关临床病史
2.临床或形态学怀疑
3.收集日期
4.标本来源
仅提交以下标本中的1个:
样品类型:血液
容器/管:薰衣草顶(EDTA)或黄色顶部(ACD-B)
标本卷:10毫升
收集说明:
1.扭转几次以混合血液。
2.在原始管中发送全血标本。不要等分。
3。标签标本为血液。
样品类型:骨髓
容器/管:薰衣草顶(EDTA)或黄色顶部(ACD-B)
标本卷:4毫升
收集说明:
1.扭转几次以混合骨髓。
2.在原始管中发送骨髓标本。不要等分。
3。标签标本为骨髓。
血液病理学患者信息(T676)
血液:8毫升
骨髓:2毫升
严重的溶血 | 拒绝 |
骨髓活检 石蜡包裹的骨髓凝块 幻灯片 石蜡剃须 中度至严重凝结 |
拒绝 |
标本类型 | 温度 | 时间 | 特殊容器 |
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变化 | 冷藏(首选) | 5天 | |
周围的 | 72小时 |
作为新诊断的急性脊髓性白血病患者的预后指标,核型正常,无flt3变体和作为最小残留疾病的白血病特异性标记
提取DNA和RNA。该测定由2个部分组成,这是一种基于RNA的,敏感的定量逆转录实时聚合酶链反应(RT-PCR),可检测和量化最常见的改变NPM1急性髓样白血病(AML)和基于DNA的定性,信使RNA转录本(A,B,D形式)NPM1通过片段分析进行外显子12变体筛选,该变体分析基本上检测到AML中报道的所有改变形式,包括罕见的non-a,b,d形式(在DNA水平上具有较低的灵敏度)。
急性髓样白血病(AML)是遗传上异质的肿瘤群。虽然在诊断时检测到的细胞遗传畸变是最常用的预后特征,但大约50%的AML病例显示出正常的核型,这被认为是中等风险的特征。在这个组中,flt3变体被认为是预后不良的指标。但是,在没有flt3变体,存在NPM1变体与更有利的预后有关。一种NPM1改变是一个普遍发现从头AML(占病例的25%-30%),由小插入(通常为4个基对)或涉及外显子12的删除/插入事件。三种变体高度复发,称为A型A,B和D,并且大约考虑90%NPM1改变从头AML。因此,在新诊断为AML的患者中,患有正常核型的患者,否flt3变体和一个NPM1在同一组患者中,人们认为改变的预后更好,缺乏肿瘤的肿瘤NPM1改造。此外,存在NPM1改变是评估治疗后最小疾病和治疗反应的敏感标记。
将提供解释性报告。
该测定包括2个部分:外显子12的定性屏幕NPM1改变和定量逆转录聚合酶链反应(RT-PCR)确定拷贝数NPM1笔录(相对于ABL1参考mRNA)。该策略将允许确定NPM1诊断时发生的改变以及一种高灵敏度方法,用于监测最小残留疾病后治疗后的患者。因此,将通过整合定量和定性测试结果来解释结果NPM1如果有的话,在AML诊断时确定的变更类型。因为定量RT-PCR组件仅可靠地检测并量化了3种最常见的变体类型(a,b,d),因此定性测定可能表明存在很小的可能性NPM1改变,但定量测定将(错误地)为阴性。在有新诊断的急性髓样白血病的患者中,正常的核型和无flt3变体的存在NPM1改变是预后更有利的指标。同样,随着化疗,存在,相对数量和变化的趋势NPM1Messenger RNA转录本与疾病复发的风险有关。
由于该测定法的设计,很少NPM1诊断时的改变可能无法通过更具靶向的定量聚合酶链反应分量来检测到。在这种情况下,测试的定性部分可用于有限的最小残留疾病评估,尽管灵敏度要低得多(在DNA水平上约为5%)。
1. Heath EM,Chan SM,Minden MD,Murphy T,Shlush LI,Schimmer AD:AML中NPM1突变的生物学和临床后果。白血病。2017年4月; 31(4):798-807。doi:10.1038/leu.2017.30
2. Kronke J,Schlenck RF,Jensen KO等:在NPM1突变的急性髓样白血病中监测最小残留疾病:德国 - 澳大利亚急性髓样白血病研究小组的一项研究。J Clin Oncol。2011年7月1日; 29(19):2709-2716。doi:10.1200/jco.2011.35.0371
3. Ivey A,Hills RK,Simpson MA等:评估标准风险AML中最小残留疾病。N Engl J Med。2016年2月4日; 374(5):422-433。doi:10.1056/nejmoa1507471
4. Shayegi N,Kramer M,Bornhauser M等:基于突变体NPM1的残留疾病水平是AML复发和存活的独立预后因素。血液。2013年7月4日; 122(1):83-92。doi:10.1182/Blood-2012-10-461749
从血液或骨髓中提取RNA,并进行逆转录。实时定量聚合酶链反应(PCR)是使用LC480仪表平台(Roche)从互补DNA模板中进行的。该测定目标是最常见的反复发生NPM1急性髓样白血病的改变(A,B和D插入变体)。的定量值NPM1Messenger RNA副本编号是确定的ABL1使用Delta-Delta CT方法作为参考转录本。该部分的该部分的可重复可重复的分析灵敏度(检测极限)约为0.01%。
从血液或骨髓中提取DNA,并使用放大片段的引物进行PCR分析NPM1含有易于插入变体的区域的DNA。其中一种PCR引物包含荧光标签。放大的片段大小通过毛细管电泳分离。野生型NPM1产生187碱基对(BP)的片段长度。将包含插入变体的PCR片段视为较大的片段,通常是191 bp,因为大多数变化是4 bp插入。该分析部分的分析灵敏度(检测极限)约为5%(未发表的Mayo方法)
从星期一到星期五
该测试是开发的,其性能特征由Mayo诊所以与CLIA要求一致的方式确定。该测试尚未得到美国食品药品监督管理局的清除或批准。
81310-NPM1(核素)(例如,急性髓样白血病)基因分析;外显子12变体
测试ID | 测试订单名称 | 订单loinc值 |
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NPM1Q | NPM1突变分析,V | 54448-6 |
结果ID | 测试结果名称 | 结果lainc值
仅适用于最初由表演实验室报告的度量单位表达的结果。这些值不适用于转换为其他度量单位的结果。
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MP053 | 标本类型 | 31208-2 |
605098 | 解释 | 59466-3 |
605262 | 签名病理学家 | 19139-5 |