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测试Id:LUNGR

这个测试顺序

肺癌重排测试、肿瘤

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概述

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有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

识别可能对靶向治疗的肺肿瘤同时评估多种基因参与重组导致融合转录本

肺癌患者的诊断和管理

这个测试是不用于用于血液恶性肿瘤。

遗传学测试信息
提供信息,帮助选择正确的基因测试或适当的提交测试的要求

这个测试使用下一代测序确定重组涉及(融合)碱性、ROS1 RET, NTRK1。看到激活/伴侣基因断点导致目标融合转录被肺询问面板目标基因的详细信息区域评估这个测试。

值得注意的是,这个测试执行评估重组(融合)固体肿瘤样本。

突出了

这个测试评估formalin-fixed,石蜡包埋肺癌患者的肿瘤或细胞学幻灯片重组(融合)来识别候选靶向治疗。

当前数据表明肺部癌碱性重组可能是敏感碱性抑制剂。

额外的测试
列出测试总是执行,在一个额外的费用,与最初的测试。

测试Id 报告名称 可单独购买 总是表现
SLIRV 幻灯片回顾在毫克 不,(仅法案) 是的

测试算法
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。

这个测试命令时,幻灯片回顾总是会执行一个额外的费用。

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

方法名称
一个简短的描述方法用于执行测试

聚合酶链反应(PCR)的下一代测序

纽约的状态
表明纽约国家批准的状态,如果测试是公开为纽约州立客户定货。

是的

报告名称
列出了短或缩写为一个测试版本的发布名称

肺重排测试、肿瘤

别名
列表附加测试常见的名字,作为一个帮助搜索

碱性

ROS1

受潮湿腐烂

NTRK1

肺癌重排

肺癌的融合

接下来一代测序测试

总会在

测试算法
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。

这个测试命令时,幻灯片回顾总是会执行一个额外的费用。

标本类型
描述了标本类型验证测试

不同

必要的信息

病理报告(最终或初步)至少包含以下信息必须伴随标本为了测试执行:

1。患者姓名

2。块数字必须是对所有块,幻灯片和文书工作(可以手写的文件)

3所示。组织收集日期

4所示。源的组织

标本要求
定义了执行测试所需的最佳标本和首选的体积来完成测试

这个实验需要至少20%的肿瘤细胞核。

首选的肿瘤区域有足够的百分比肿瘤细胞核:tissue180毫米(2)

最小数量的肿瘤区域:组织36毫米(2)

这些数量累计超过10清白的幻灯片,必须有足够的百分比肿瘤细胞核。

组织固定:10%中性缓冲福尔马林,不脱钙

——样品制备的指导,请参阅实体瘤组织要求下一代测序。在本文档中,给出的尺寸4毫米x 4毫米x 10幻灯片作为首选:近似/相当于144毫米(2)和最低3毫米x 1毫米x 10幻灯片:近似/相当于36毫米(2)。

首选:

样品类型:组织块

收集产品说明:提交formalin-fixed,石蜡包埋组织块可接受数量的肿瘤组织。

可以接受的:

样品类型:组织的幻灯片

幻灯片:1彩色和10个清白的

收集产品说明:提交1张幻灯片与苏木精和伊红染色和10清白的,nonbaked幻灯片5微米厚的部分肿瘤组织。

注意:需要肿瘤细胞核的总量可以通过刮10幻灯片从同一块。

样品类型:细胞学幻灯片(直接涂片或ThinPrep)

幻灯片:1到3张幻灯片

收集产品说明:提交1 - 3张幻灯片染色和封面下滑首选5000有核细胞或至少至少3000有核细胞。

注意:玻璃盖玻片是首选;塑料盖玻片是可以接受的,但将导致周转时间过长。

附加信息:细胞学幻灯片恕不退还。

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

形式

如果不是电子订购,完成,打印,发送一个肿瘤学试验要求(T729)标本。

试样体积最小
定义样本的数量必须提供一个临床相关的结果取决于测试实验室

看到标本要求

拒绝原因
识别标本类型和条件可能会导致样品被拒绝

其他 标本已脱钙(所有方法)标本,尚未formalin-fixed,石蜡包埋

样品稳定性信息
提供了一个描述运输所需的温度进行实验室的标本,替代还包括可接受的温度

标本类型 温度 时间 特种集装箱
不同 环境(首选)
冻
冷藏

有用的
建议临床疾病或设置的测试可能是有益的

识别可能对靶向治疗的肺肿瘤同时评估多种基因参与重组导致融合转录本

肺癌患者的诊断和管理

这个测试是不用于用于血液恶性肿瘤。

遗传学测试信息
提供信息,帮助选择正确的基因测试或适当的提交测试的要求

这个测试使用下一代测序确定重组涉及(融合)碱性、ROS1 RET, NTRK1。看到激活/伴侣基因断点导致目标融合转录被肺询问面板目标基因的详细信息区域评估这个测试。

值得注意的是,这个测试执行评估重组(融合)固体肿瘤样本。

测试算法
划定的情况下当测试被添加到最初的秩序。这包括反射和额外的测试。

这个测试命令时,幻灯片回顾总是会执行一个额外的费用。

临床信息
讨论了生理学、病理生理学和一般临床方面,与实验室测试

有针对性的癌症疗法被定义为抗体或小分子药物阻断癌症的生长和传播通过干扰细胞的特定分子参与肿瘤的生长和发展。多个靶向治疗已被FDA批准用于治疗特定的癌症。分子遗传学分析通常需要确定目标服从于靶向治疗和治疗费用和治疗相关性风险降到最低。

下一代测序最近成为一个准确的,具有成本效益的方法来识别变化等多个相关基因已知反应或抵抗特定的靶向治疗。这个测试使用formalin-fixed石蜡包埋组织或细胞学幻灯片来评估为常见的重组(融合)涉及4已知与肺癌有关的基因。本次测试的结果可以用于评估预后和指导治疗肺肿瘤患者。这些数据也可以用来帮助确定临床试验资格改变患者的基因不适合当前fda批准的靶向治疗。

看到激活/伴侣基因断点导致目标融合转录被肺询问面板目标基因的详细信息区域评估这个测试。

参考价值
描述参考区间和附加信息的解释测试结果。可能包括在适当的时间间隔根据年龄和性别。间隔Mayo-derived,除非另有指定。如果一个提供解释报告,参考价值字段将这个状态。

一个将提供解释报告。

解释
提供信息,协助解释测试结果

一个将提供解释报告。

注意事项
讨论了条件,可能会导致诊断的混乱,包括样本收集和处理不当,不恰当的测试选择、干扰物质

这个测试不能区分体细胞和生殖系的变化。额外的测试可能需要澄清结果的意义是否有潜在的遗传风险。

负(野生型)结果不排除存在重排(融合)可能存在但低于极限的检测分析。

基因融合(重组)涉及碱性、ROS1仓促和NTRK1基因只有将被检测到。这个测试没有发现点突变,插入/删除突变,大单或multiexon删除或复制,或基因组拷贝数变异的基因测试。

罕见的多态性可能存在可能导致假阴性或假阳性结果。测试结果应解释在临床中发现,肿瘤采样,和其他实验室数据。如果结果不匹配其他临床或实验室发现,请联系实验室更新的解释。误解的结果可能发生如果提供的信息不准确或不完整的。

可靠的结果依赖于足够的样本收集和处理。这个测试已验证细胞学幻灯片和formalin-fixed石蜡包埋组织;其他类型的固定液是气馁。组织的治疗不当,如脱钙作用,可能会导致PCR失败。

支持数据

我们已经开发了下一代测序分析来检测基因重组(融合),可用于协助识别和预测预后靶向治疗对于肺癌患者的管理。这个试验已被证明是可再生的,有100%的一致性为内部和interassay再现性实验。

我们观察到100%的一致性,检测重组导致融合转录本在26个26独特的样品与之前检测到荧光原位杂交(鱼)或另一个测序分析。这些重组涉及到碱性(n = 19),ROS1 (n = 3),并且仓促(n = 4)基因。未发现融合转录本在72年独特的样本,互斥的突变或负重组鱼作为评估标准分析。

临床参考
对临床性质的深入阅读的建议

1。Mok TS:个性化医疗在肺癌:我们需要知道。Nat牧师肿瘤防治杂志2011;8:661 - 668

2。程L,亚历山大•再保险•麦乐伦GT, et al:肺癌的分子病理学:个性化医疗的关键。国防部路径2012;25 (3):346 - 369

3所示。竹内K,苏打,Togashi Y, et al: RET, ROS1和筛选融合在肺癌。Nat杂志2012;18 (3):378 - 381

4所示。Vaishnavi, Capelletti M, Le, et al:致癌和非NTRK1重组在肺癌。Nat地中海2013年11月,19 (11):1469 - 1472

特殊指令
图书馆的pdf文件,包括相关信息并形成相关的测试

方法描述
描述如何执行测试并提供method-specific参考

下一代测序测试执行重组涉及的存在碱性、ROS1 RET,和NTRK1基因。看到激活/伴侣基因断点导致目标融合转录被肺询问面板有关详细信息,关于这个测试发现的有针对性的基因区域。(未发表的梅奥法)

PDF报告
表明报告包括一个额外的文档是否与图表、图像或其他丰富的信息

没有

天(s)
概述了天测试执行。这个领域反映了天,样品必须在测试实验室开始测试过程,包括任何样品制备和测试执行之前处理时间。列出了一些测试,不断进行,这意味着化验白天多次执行。

星期一到星期五

报告可用
时间的间隔(收到样品在梅奥诊所实验室结果可用)考虑标准设置和周末。betway中国版第一天的时间通常是结果可用。最后一天的时间可能需要,占任何必要的重复测试。

12至20天

样品保留时间
轮廓的时间在测试标本保存在实验室之前就会被丢弃

FFPE组织:将返回未使用的块部分。细胞学幻灯片:不将返回幻灯片。

执行实验室的位置
表明实验室的位置执行测试

罗彻斯特

费用
几个因素决定执行一个测试的费用收取。联系你的美国或国际区域经理建立费用表的信息或了解更多关于资源优化测试的选择。

测试的分类
提供信息关于医疗器械分类为实验室测试工具和试剂。测试可以分为清除或通过美国食品和药物管理局(FDA)和每个制造商使用说明,或产品,不接受FDA审查和批准,并贴上一个分析物特定试剂(ASR)产品。

这个测试开发,其性能特征由梅奥诊所的方式与CLIA要求一致。这个测试没有被清除或得到美国食品和药物管理局的批准。

CPT编码信息
提供指导在决定适当的当前程序的术语(CPT)代码(s)为每个测试或概要信息。梅奥诊所上市CPT编码反映实验室的解释CPT编码需求。betway中国版每个实验室有责任来确定正确的CPT编码用于计费。

CPT编码由执行实验室提供。

81405年受潮湿腐烂

81479 - (ROS1 alaska airlines, NTKR1)

幻灯片回顾

88381 -显微解剖,手册

LOINC®信息
提供指导在确定逻辑观察标识符名称和代码(LOINC)值的顺序和结果代码的测试。LOINC表演实验室提供的值。

测试Id 测试顺序的名字 订单LOINC价值
LUNGR 肺重排测试、肿瘤 过程中
结果Id 测试结果的名字 结果LOINC值
仅适用于测量结果表示在单位最初报告的执行实验室。并不适用于这些值转换为其他单位的测量结果。
43702年 结果总结 50397 - 9
43703年 结果 95123 - 6
44138年 解释 69047 - 9
44139年 额外的信息 48767 - 8
44140年 标本 31208 - 2
44141年 源 31208 - 2
46911年 组织ID 80398 - 1
44142年 发布的 18771 - 6

测试设置资源

设置文件
测试设置信息包含测试文件定义支持订单细节和结果之间的接口梅奥诊所实验室和实验室信息系统。betway中国版

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样品报告
正常和异常样本报告作为参考提供报告的外观。

正常的报告|异常报告

如果样品报告
国际体系(SI)的单位报告提供有限数量的测试。这些报告仅用于国际帐户,只可以通过MayoLINK账户已定义接收他们。

如果正常的报告|如果异常报告